Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRIP1P50238 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRIP1P50238 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRIP1P50238 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRIP1P50238 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRIP1P50238 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CRIP1P50238 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CRIP1P50238 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRIP1P50238 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRIP1P50238 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRIP1P50238 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRIP1P50238 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRIP1P50238 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRIP1P50238 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRIP1P50238 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRIP1P50238 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRIP1P50238 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRIP1P50238 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRIP1P50238 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRIP1P50238 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CRIP1P50238 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRIP1P50238 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRIP1P50238 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP1P50238 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms