Protein–RNA interactions for Protein: P49767

VEGFC, Vascular endothelial growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFCP49767 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFCP49767 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFCP49767 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFCP49767 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFCP49767 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFCP49767 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFCP49767 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFCP49767 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFCP49767 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFCP49767 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
VEGFCP49767 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VEGFCP49767 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VEGFCP49767 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VEGFCP49767 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VEGFCP49767 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VEGFCP49767 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VEGFCP49767 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VEGFCP49767 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VEGFCP49767 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VEGFCP49767 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFCP49767 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFCP49767 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFCP49767 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFCP49767 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFCP49767 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFCP49767 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFCP49767 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFCP49767 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFCP49767 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFCP49767 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFCP49767 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFCP49767 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFCP49767 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFCP49767 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFCP49767 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFCP49767 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFCP49767 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFCP49767 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms