Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NMUP48645 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NMUP48645 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMUP48645 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMUP48645 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMUP48645 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMUP48645 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMUP48645 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMUP48645 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMUP48645 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMUP48645 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMUP48645 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMUP48645 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMUP48645 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMUP48645 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMUP48645 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMUP48645 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMUP48645 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMUP48645 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMUP48645 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMUP48645 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMUP48645 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMUP48645 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMUP48645 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMUP48645 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMUP48645 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMUP48645 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMUP48645 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMUP48645 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMUP48645 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMUP48645 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMUP48645 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMUP48645 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMUP48645 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMUP48645 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMUP48645 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMUP48645 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMUP48645 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMUP48645 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMUP48645 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMUP48645 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMUP48645 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMUP48645 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMUP48645 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMUP48645 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMUP48645 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMUP48645 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMUP48645 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMUP48645 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMUP48645 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMUP48645 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMUP48645 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMUP48645 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMUP48645 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMUP48645 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NMUP48645 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMUP48645 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMUP48645 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMUP48645 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMUP48645 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMUP48645 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NMUP48645 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMUP48645 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMUP48645 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMUP48645 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NMUP48645 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMUP48645 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMUP48645 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMUP48645 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMUP48645 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMUP48645 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMUP48645 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMUP48645 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMUP48645 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMUP48645 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMUP48645 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMUP48645 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMUP48645 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMUP48645 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMUP48645 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMUP48645 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMUP48645 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMUP48645 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMUP48645 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMUP48645 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMUP48645 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMUP48645 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMUP48645 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NMUP48645 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMUP48645 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMUP48645 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMUP48645 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMUP48645 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMUP48645 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NMUP48645 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NMUP48645 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NMUP48645 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NMUP48645 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMUP48645 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMUP48645 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms