Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIA1P42261 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIA1P42261 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIA1P42261 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIA1P42261 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIA1P42261 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIA1P42261 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIA1P42261 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIA1P42261 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIA1P42261 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIA1P42261 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIA1P42261 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIA1P42261 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIA1P42261 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIA1P42261 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIA1P42261 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIA1P42261 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIA1P42261 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIA1P42261 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIA1P42261 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIA1P42261 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIA1P42261 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIA1P42261 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIA1P42261 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIA1P42261 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIA1P42261 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIA1P42261 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIA1P42261 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GRIA1P42261 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GRIA1P42261 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIA1P42261 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIA1P42261 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIA1P42261 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIA1P42261 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIA1P42261 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIA1P42261 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIA1P42261 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIA1P42261 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIA1P42261 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIA1P42261 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIA1P42261 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIA1P42261 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIA1P42261 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIA1P42261 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIA1P42261 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIA1P42261 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIA1P42261 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIA1P42261 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIA1P42261 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIA1P42261 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIA1P42261 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIA1P42261 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIA1P42261 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIA1P42261 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIA1P42261 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIA1P42261 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIA1P42261 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIA1P42261 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIA1P42261 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIA1P42261 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIA1P42261 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIA1P42261 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIA1P42261 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIA1P42261 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIA1P42261 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIA1P42261 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIA1P42261 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIA1P42261 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIA1P42261 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIA1P42261 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIA1P42261 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIA1P42261 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIA1P42261 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIA1P42261 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIA1P42261 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIA1P42261 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIA1P42261 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIA1P42261 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIA1P42261 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIA1P42261 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIA1P42261 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIA1P42261 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIA1P42261 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIA1P42261 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIA1P42261 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIA1P42261 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIA1P42261 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIA1P42261 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIA1P42261 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIA1P42261 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIA1P42261 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIA1P42261 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIA1P42261 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIA1P42261 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIA1P42261 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIA1P42261 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIA1P42261 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIA1P42261 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIA1P42261 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIA1P42261 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms