Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNFP41002 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNFP41002 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNFP41002 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNFP41002 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNFP41002 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNFP41002 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNFP41002 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNFP41002 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNFP41002 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNFP41002 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNFP41002 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNFP41002 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNFP41002 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNFP41002 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNFP41002 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNFP41002 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNFP41002 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNFP41002 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNFP41002 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNFP41002 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNFP41002 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNFP41002 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCNFP41002 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCNFP41002 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNFP41002 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNFP41002 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNFP41002 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNFP41002 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNFP41002 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNFP41002 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNFP41002 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNFP41002 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNFP41002 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNFP41002 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNFP41002 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNFP41002 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNFP41002 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNFP41002 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNFP41002 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNFP41002 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNFP41002 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNFP41002 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNFP41002 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNFP41002 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNFP41002 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNFP41002 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNFP41002 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNFP41002 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNFP41002 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNFP41002 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCNFP41002 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCNFP41002 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCNFP41002 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCNFP41002 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCNFP41002 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNFP41002 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNFP41002 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNFP41002 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNFP41002 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNFP41002 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNFP41002 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCNFP41002 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNFP41002 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNFP41002 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNFP41002 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNFP41002 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNFP41002 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNFP41002 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNFP41002 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNFP41002 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNFP41002 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNFP41002 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNFP41002 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNFP41002 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNFP41002 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNFP41002 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNFP41002 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNFP41002 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNFP41002 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNFP41002 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNFP41002 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNFP41002 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNFP41002 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNFP41002 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNFP41002 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNFP41002 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNFP41002 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNFP41002 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNFP41002 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNFP41002 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNFP41002 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNFP41002 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNFP41002 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNFP41002 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNFP41002 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNFP41002 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNFP41002 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNFP41002 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNFP41002 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms