Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGCXP38435 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GGCXP38435 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGCXP38435 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGCXP38435 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGCXP38435 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GGCXP38435 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GGCXP38435 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GGCXP38435 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GGCXP38435 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GGCXP38435 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GGCXP38435 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GGCXP38435 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GGCXP38435 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGCXP38435 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GGCXP38435 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GGCXP38435 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GGCXP38435 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GGCXP38435 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GGCXP38435 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GGCXP38435 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GGCXP38435 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GGCXP38435 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGCXP38435 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GGCXP38435 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GGCXP38435 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GGCXP38435 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGCXP38435 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGCXP38435 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGCXP38435 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GGCXP38435 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GGCXP38435 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GGCXP38435 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
GGCXP38435 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGCXP38435 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGCXP38435 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGCXP38435 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGCXP38435 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GGCXP38435 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GGCXP38435 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GGCXP38435 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GGCXP38435 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGCXP38435 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGCXP38435 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGCXP38435 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGCXP38435 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGCXP38435 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGCXP38435 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGCXP38435 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GGCXP38435 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGCXP38435 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGCXP38435 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGCXP38435 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGCXP38435 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGCXP38435 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGCXP38435 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGCXP38435 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGCXP38435 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGCXP38435 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
GGCXP38435 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGCXP38435 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGCXP38435 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGCXP38435 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGCXP38435 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGCXP38435 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGCXP38435 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGCXP38435 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGCXP38435 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGCXP38435 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GGCXP38435 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GGCXP38435 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GGCXP38435 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GGCXP38435 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GGCXP38435 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GGCXP38435 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GGCXP38435 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GGCXP38435 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GGCXP38435 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GGCXP38435 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GGCXP38435 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GGCXP38435 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GGCXP38435 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GGCXP38435 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GGCXP38435 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GGCXP38435 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GGCXP38435 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GGCXP38435 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GGCXP38435 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GGCXP38435 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GGCXP38435 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GGCXP38435 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GGCXP38435 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GGCXP38435 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GGCXP38435 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GGCXP38435 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GGCXP38435 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GGCXP38435 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GGCXP38435 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GGCXP38435 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GGCXP38435 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms