Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP214P35658 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP214P35658 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP214P35658 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP214P35658 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP214P35658 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP214P35658 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP214P35658 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP214P35658 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP214P35658 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP214P35658 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP214P35658 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP214P35658 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP214P35658 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP214P35658 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP214P35658 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP214P35658 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP214P35658 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP214P35658 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP214P35658 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUP214P35658 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP214P35658 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP214P35658 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP214P35658 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP214P35658 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP214P35658 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP214P35658 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP214P35658 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP214P35658 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP214P35658 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP214P35658 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP214P35658 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP214P35658 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP214P35658 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP214P35658 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP214P35658 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP214P35658 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP214P35658 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP214P35658 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP214P35658 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP214P35658 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP214P35658 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP214P35658 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP214P35658 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP214P35658 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP214P35658 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP214P35658 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP214P35658 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP214P35658 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP214P35658 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP214P35658 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP214P35658 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP214P35658 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP214P35658 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP214P35658 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP214P35658 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP214P35658 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP214P35658 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP214P35658 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP214P35658 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP214P35658 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP214P35658 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP214P35658 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP214P35658 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP214P35658 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP214P35658 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP214P35658 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP214P35658 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP214P35658 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP214P35658 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP214P35658 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP214P35658 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP214P35658 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP214P35658 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUP214P35658 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUP214P35658 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUP214P35658 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP214P35658 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP214P35658 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP214P35658 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP214P35658 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP214P35658 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP214P35658 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP214P35658 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP214P35658 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP214P35658 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP214P35658 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP214P35658 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP214P35658 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP214P35658 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP214P35658 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP214P35658 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP214P35658 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP214P35658 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP214P35658 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP214P35658 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP214P35658 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP214P35658 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP214P35658 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP214P35658 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms