Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD12P35452 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD12P35452 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD12P35452 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD12P35452 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD12P35452 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD12P35452 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD12P35452 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD12P35452 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD12P35452 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD12P35452 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD12P35452 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD12P35452 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD12P35452 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD12P35452 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD12P35452 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD12P35452 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXD12P35452 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXD12P35452 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD12P35452 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD12P35452 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXD12P35452 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXD12P35452 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXD12P35452 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXD12P35452 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXD12P35452 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD12P35452 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD12P35452 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD12P35452 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD12P35452 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD12P35452 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD12P35452 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD12P35452 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD12P35452 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXD12P35452 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXD12P35452 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HOXD12P35452 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HOXD12P35452 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD12P35452 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD12P35452 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD12P35452 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD12P35452 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD12P35452 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD12P35452 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD12P35452 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD12P35452 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD12P35452 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD12P35452 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD12P35452 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD12P35452 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD12P35452 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD12P35452 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD12P35452 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD12P35452 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD12P35452 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD12P35452 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD12P35452 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD12P35452 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD12P35452 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD12P35452 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD12P35452 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD12P35452 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD12P35452 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD12P35452 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD12P35452 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD12P35452 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD12P35452 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD12P35452 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD12P35452 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD12P35452 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD12P35452 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HOXD12P35452 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD12P35452 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD12P35452 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD12P35452 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD12P35452 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD12P35452 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD12P35452 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD12P35452 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD12P35452 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD12P35452 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD12P35452 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD12P35452 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD12P35452 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD12P35452 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD12P35452 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD12P35452 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD12P35452 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD12P35452 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD12P35452 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD12P35452 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD12P35452 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXD12P35452 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXD12P35452 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXD12P35452 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD12P35452 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXD12P35452 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXD12P35452 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXD12P35452 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD12P35452 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms