Protein–RNA interactions for Protein: P35442

THBS2, Thrombospondin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS2P35442 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THBS2P35442 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THBS2P35442 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THBS2P35442 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THBS2P35442 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
THBS2P35442 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
THBS2P35442 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THBS2P35442 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THBS2P35442 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THBS2P35442 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THBS2P35442 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THBS2P35442 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THBS2P35442 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THBS2P35442 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THBS2P35442 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THBS2P35442 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THBS2P35442 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
THBS2P35442 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THBS2P35442 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THBS2P35442 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THBS2P35442 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THBS2P35442 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THBS2P35442 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
THBS2P35442 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THBS2P35442 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THBS2P35442 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THBS2P35442 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THBS2P35442 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THBS2P35442 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THBS2P35442 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THBS2P35442 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THBS2P35442 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THBS2P35442 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THBS2P35442 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
THBS2P35442 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THBS2P35442 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THBS2P35442 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THBS2P35442 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THBS2P35442 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THBS2P35442 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THBS2P35442 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THBS2P35442 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THBS2P35442 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THBS2P35442 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THBS2P35442 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THBS2P35442 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THBS2P35442 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THBS2P35442 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THBS2P35442 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THBS2P35442 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THBS2P35442 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THBS2P35442 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THBS2P35442 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THBS2P35442 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THBS2P35442 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
THBS2P35442 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THBS2P35442 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THBS2P35442 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THBS2P35442 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THBS2P35442 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
THBS2P35442 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THBS2P35442 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THBS2P35442 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THBS2P35442 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THBS2P35442 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THBS2P35442 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THBS2P35442 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THBS2P35442 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THBS2P35442 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THBS2P35442 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THBS2P35442 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THBS2P35442 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THBS2P35442 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THBS2P35442 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THBS2P35442 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THBS2P35442 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THBS2P35442 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THBS2P35442 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THBS2P35442 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THBS2P35442 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THBS2P35442 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THBS2P35442 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THBS2P35442 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THBS2P35442 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THBS2P35442 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THBS2P35442 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THBS2P35442 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
THBS2P35442 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
THBS2P35442 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THBS2P35442 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THBS2P35442 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THBS2P35442 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THBS2P35442 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THBS2P35442 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THBS2P35442 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THBS2P35442 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THBS2P35442 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THBS2P35442 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THBS2P35442 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THBS2P35442 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms