Protein–RNA interactions for Protein: P35442

THBS2, Thrombospondin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS2P35442 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
THBS2P35442 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
THBS2P35442 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
THBS2P35442 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
THBS2P35442 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
THBS2P35442 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
THBS2P35442 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
THBS2P35442 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
THBS2P35442 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
THBS2P35442 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
THBS2P35442 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
THBS2P35442 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
THBS2P35442 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
THBS2P35442 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
THBS2P35442 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
THBS2P35442 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
THBS2P35442 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
THBS2P35442 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
THBS2P35442 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
THBS2P35442 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
THBS2P35442 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
THBS2P35442 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
THBS2P35442 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
THBS2P35442 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
THBS2P35442 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
THBS2P35442 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
THBS2P35442 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
THBS2P35442 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
THBS2P35442 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
THBS2P35442 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
THBS2P35442 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
THBS2P35442 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
THBS2P35442 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
THBS2P35442 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
THBS2P35442 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
THBS2P35442 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
THBS2P35442 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
THBS2P35442 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
THBS2P35442 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THBS2P35442 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THBS2P35442 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
THBS2P35442 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
THBS2P35442 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
THBS2P35442 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
THBS2P35442 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
THBS2P35442 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
THBS2P35442 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
THBS2P35442 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
THBS2P35442 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
THBS2P35442 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
THBS2P35442 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
THBS2P35442 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
THBS2P35442 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
THBS2P35442 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
THBS2P35442 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
THBS2P35442 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
THBS2P35442 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
THBS2P35442 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
THBS2P35442 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
THBS2P35442 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
THBS2P35442 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
THBS2P35442 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
THBS2P35442 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THBS2P35442 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
THBS2P35442 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
THBS2P35442 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
THBS2P35442 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
THBS2P35442 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
THBS2P35442 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
THBS2P35442 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
THBS2P35442 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
THBS2P35442 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
THBS2P35442 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
THBS2P35442 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
THBS2P35442 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THBS2P35442 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THBS2P35442 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THBS2P35442 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
THBS2P35442 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THBS2P35442 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THBS2P35442 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
THBS2P35442 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
THBS2P35442 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THBS2P35442 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THBS2P35442 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
THBS2P35442 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
THBS2P35442 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THBS2P35442 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
THBS2P35442 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THBS2P35442 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THBS2P35442 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
THBS2P35442 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THBS2P35442 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THBS2P35442 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
THBS2P35442 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THBS2P35442 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THBS2P35442 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THBS2P35442 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
THBS2P35442 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
THBS2P35442 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms