Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RPA3P35244 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPA3P35244 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RPA3P35244 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPA3P35244 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPA3P35244 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPA3P35244 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPA3P35244 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPA3P35244 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPA3P35244 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPA3P35244 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPA3P35244 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPA3P35244 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPA3P35244 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPA3P35244 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPA3P35244 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPA3P35244 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPA3P35244 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPA3P35244 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPA3P35244 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPA3P35244 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPA3P35244 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPA3P35244 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPA3P35244 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPA3P35244 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPA3P35244 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPA3P35244 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPA3P35244 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPA3P35244 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPA3P35244 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPA3P35244 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPA3P35244 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPA3P35244 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPA3P35244 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RPA3P35244 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPA3P35244 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPA3P35244 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RPA3P35244 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPA3P35244 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPA3P35244 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPA3P35244 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPA3P35244 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPA3P35244 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPA3P35244 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPA3P35244 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPA3P35244 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA3P35244 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA3P35244 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA3P35244 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA3P35244 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA3P35244 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA3P35244 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA3P35244 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA3P35244 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA3P35244 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA3P35244 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RPA3P35244 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPA3P35244 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPA3P35244 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPA3P35244 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPA3P35244 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPA3P35244 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPA3P35244 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPA3P35244 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPA3P35244 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPA3P35244 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPA3P35244 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPA3P35244 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPA3P35244 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPA3P35244 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPA3P35244 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RPA3P35244 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
RPA3P35244 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPA3P35244 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPA3P35244 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPA3P35244 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPA3P35244 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPA3P35244 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPA3P35244 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPA3P35244 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPA3P35244 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPA3P35244 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPA3P35244 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPA3P35244 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPA3P35244 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPA3P35244 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPA3P35244 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPA3P35244 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPA3P35244 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPA3P35244 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPA3P35244 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPA3P35244 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPA3P35244 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPA3P35244 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RPA3P35244 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPA3P35244 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPA3P35244 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPA3P35244 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPA3P35244 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPA3P35244 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms