Protein–RNA interactions for Protein: P34741

SDC2, Syndecan-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC2P34741 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDC2P34741 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDC2P34741 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDC2P34741 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDC2P34741 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDC2P34741 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDC2P34741 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDC2P34741 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SDC2P34741 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDC2P34741 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDC2P34741 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDC2P34741 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDC2P34741 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDC2P34741 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDC2P34741 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDC2P34741 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDC2P34741 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDC2P34741 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDC2P34741 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDC2P34741 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDC2P34741 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDC2P34741 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDC2P34741 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDC2P34741 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDC2P34741 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDC2P34741 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDC2P34741 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SDC2P34741 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDC2P34741 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDC2P34741 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDC2P34741 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDC2P34741 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDC2P34741 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDC2P34741 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDC2P34741 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDC2P34741 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDC2P34741 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDC2P34741 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDC2P34741 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDC2P34741 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDC2P34741 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDC2P34741 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDC2P34741 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SDC2P34741 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SDC2P34741 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDC2P34741 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDC2P34741 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDC2P34741 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDC2P34741 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDC2P34741 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDC2P34741 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDC2P34741 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDC2P34741 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDC2P34741 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDC2P34741 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDC2P34741 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDC2P34741 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDC2P34741 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDC2P34741 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDC2P34741 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SDC2P34741 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDC2P34741 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDC2P34741 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SDC2P34741 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDC2P34741 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDC2P34741 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDC2P34741 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDC2P34741 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDC2P34741 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDC2P34741 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDC2P34741 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDC2P34741 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDC2P34741 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDC2P34741 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDC2P34741 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDC2P34741 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDC2P34741 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDC2P34741 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDC2P34741 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDC2P34741 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDC2P34741 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDC2P34741 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDC2P34741 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SDC2P34741 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDC2P34741 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDC2P34741 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDC2P34741 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDC2P34741 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDC2P34741 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDC2P34741 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDC2P34741 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDC2P34741 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDC2P34741 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDC2P34741 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDC2P34741 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDC2P34741 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDC2P34741 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDC2P34741 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDC2P34741 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDC2P34741 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.6 ms