Protein–RNA interactions for Protein: P31152

MAPK4, Mitogen-activated protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPK4P31152 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MAPK4P31152 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MAPK4P31152 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MAPK4P31152 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MAPK4P31152 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MAPK4P31152 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MAPK4P31152 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MAPK4P31152 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MAPK4P31152 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MAPK4P31152 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MAPK4P31152 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MAPK4P31152 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
MAPK4P31152 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
MAPK4P31152 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MAPK4P31152 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MAPK4P31152 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
MAPK4P31152 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MAPK4P31152 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MAPK4P31152 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MAPK4P31152 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MAPK4P31152 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MAPK4P31152 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MAPK4P31152 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MAPK4P31152 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MAPK4P31152 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MAPK4P31152 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MAPK4P31152 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
MAPK4P31152 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MAPK4P31152 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MAPK4P31152 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MAPK4P31152 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MAPK4P31152 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MAPK4P31152 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MAPK4P31152 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MAPK4P31152 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MAPK4P31152 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MAPK4P31152 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MAPK4P31152 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MAPK4P31152 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MAPK4P31152 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MAPK4P31152 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MAPK4P31152 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MAPK4P31152 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MAPK4P31152 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MAPK4P31152 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MAPK4P31152 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
MAPK4P31152 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MAPK4P31152 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MAPK4P31152 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MAPK4P31152 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
MAPK4P31152 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MAPK4P31152 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MAPK4P31152 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MAPK4P31152 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MAPK4P31152 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MAPK4P31152 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MAPK4P31152 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MAPK4P31152 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
MAPK4P31152 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MAPK4P31152 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MAPK4P31152 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MAPK4P31152 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MAPK4P31152 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MAPK4P31152 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
MAPK4P31152 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MAPK4P31152 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MAPK4P31152 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MAPK4P31152 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MAPK4P31152 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
MAPK4P31152 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MAPK4P31152 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MAPK4P31152 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms