Protein–RNA interactions for Protein: P29558

RBMS1, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1P29558 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBMS1P29558 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBMS1P29558 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBMS1P29558 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBMS1P29558 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBMS1P29558 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBMS1P29558 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBMS1P29558 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBMS1P29558 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBMS1P29558 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBMS1P29558 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RBMS1P29558 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBMS1P29558 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RBMS1P29558 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBMS1P29558 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RBMS1P29558 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBMS1P29558 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBMS1P29558 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RBMS1P29558 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBMS1P29558 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBMS1P29558 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBMS1P29558 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBMS1P29558 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBMS1P29558 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBMS1P29558 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBMS1P29558 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBMS1P29558 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBMS1P29558 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RBMS1P29558 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBMS1P29558 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBMS1P29558 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBMS1P29558 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RBMS1P29558 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RBMS1P29558 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBMS1P29558 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBMS1P29558 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBMS1P29558 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBMS1P29558 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBMS1P29558 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBMS1P29558 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBMS1P29558 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBMS1P29558 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBMS1P29558 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBMS1P29558 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBMS1P29558 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBMS1P29558 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBMS1P29558 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBMS1P29558 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBMS1P29558 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBMS1P29558 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBMS1P29558 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBMS1P29558 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBMS1P29558 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBMS1P29558 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBMS1P29558 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBMS1P29558 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBMS1P29558 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBMS1P29558 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBMS1P29558 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBMS1P29558 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBMS1P29558 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBMS1P29558 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBMS1P29558 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBMS1P29558 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBMS1P29558 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBMS1P29558 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBMS1P29558 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBMS1P29558 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBMS1P29558 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBMS1P29558 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBMS1P29558 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBMS1P29558 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBMS1P29558 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBMS1P29558 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBMS1P29558 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBMS1P29558 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBMS1P29558 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBMS1P29558 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBMS1P29558 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBMS1P29558 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBMS1P29558 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBMS1P29558 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBMS1P29558 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RBMS1P29558 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBMS1P29558 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBMS1P29558 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBMS1P29558 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBMS1P29558 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBMS1P29558 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBMS1P29558 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBMS1P29558 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
RBMS1P29558 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RBMS1P29558 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RBMS1P29558 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBMS1P29558 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBMS1P29558 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBMS1P29558 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RBMS1P29558 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RBMS1P29558 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBMS1P29558 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms