Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SERPINB3P29508 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SERPINB3P29508 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SERPINB3P29508 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SERPINB3P29508 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SERPINB3P29508 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SERPINB3P29508 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SERPINB3P29508 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SERPINB3P29508 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SERPINB3P29508 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPINB3P29508 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPINB3P29508 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPINB3P29508 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPINB3P29508 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPINB3P29508 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SERPINB3P29508 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINB3P29508 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINB3P29508 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINB3P29508 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINB3P29508 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINB3P29508 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINB3P29508 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINB3P29508 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINB3P29508 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINB3P29508 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINB3P29508 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SERPINB3P29508 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SERPINB3P29508 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SERPINB3P29508 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SERPINB3P29508 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SERPINB3P29508 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SERPINB3P29508 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SERPINB3P29508 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SERPINB3P29508 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SERPINB3P29508 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SERPINB3P29508 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SERPINB3P29508 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SERPINB3P29508 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SERPINB3P29508 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SERPINB3P29508 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SERPINB3P29508 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SERPINB3P29508 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms