Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CASP1P29466 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CASP1P29466 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CASP1P29466 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASP1P29466 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CASP1P29466 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASP1P29466 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CASP1P29466 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CASP1P29466 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASP1P29466 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASP1P29466 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASP1P29466 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASP1P29466 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASP1P29466 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASP1P29466 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASP1P29466 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CASP1P29466 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CASP1P29466 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CASP1P29466 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CASP1P29466 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CASP1P29466 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CASP1P29466 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CASP1P29466 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CASP1P29466 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP1P29466 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP1P29466 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP1P29466 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP1P29466 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CASP1P29466 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CASP1P29466 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CASP1P29466 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CASP1P29466 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASP1P29466 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CASP1P29466 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CASP1P29466 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CASP1P29466 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CASP1P29466 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASP1P29466 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASP1P29466 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASP1P29466 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASP1P29466 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASP1P29466 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASP1P29466 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASP1P29466 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASP1P29466 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASP1P29466 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASP1P29466 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASP1P29466 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASP1P29466 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASP1P29466 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASP1P29466 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASP1P29466 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASP1P29466 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASP1P29466 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASP1P29466 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASP1P29466 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASP1P29466 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASP1P29466 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASP1P29466 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASP1P29466 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASP1P29466 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASP1P29466 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASP1P29466 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASP1P29466 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASP1P29466 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASP1P29466 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASP1P29466 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASP1P29466 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASP1P29466 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASP1P29466 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASP1P29466 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASP1P29466 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASP1P29466 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASP1P29466 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASP1P29466 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CASP1P29466 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CASP1P29466 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CASP1P29466 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CASP1P29466 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CASP1P29466 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CASP1P29466 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CASP1P29466 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASP1P29466 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASP1P29466 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CASP1P29466 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CASP1P29466 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CASP1P29466 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CASP1P29466 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CASP1P29466 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CASP1P29466 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CASP1P29466 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CASP1P29466 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASP1P29466 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASP1P29466 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASP1P29466 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASP1P29466 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASP1P29466 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CASP1P29466 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASP1P29466 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASP1P29466 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms