Protein–RNA interactions for Protein: P25685

DNAJB1, DnaJ homolog subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB1P25685 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAJB1P25685 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNAJB1P25685 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNAJB1P25685 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNAJB1P25685 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNAJB1P25685 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNAJB1P25685 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNAJB1P25685 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNAJB1P25685 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DNAJB1P25685 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNAJB1P25685 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNAJB1P25685 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DNAJB1P25685 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DNAJB1P25685 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
DNAJB1P25685 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DNAJB1P25685 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNAJB1P25685 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNAJB1P25685 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNAJB1P25685 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNAJB1P25685 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNAJB1P25685 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNAJB1P25685 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNAJB1P25685 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DNAJB1P25685 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DNAJB1P25685 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNAJB1P25685 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNAJB1P25685 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNAJB1P25685 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNAJB1P25685 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNAJB1P25685 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DNAJB1P25685 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DNAJB1P25685 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DNAJB1P25685 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DNAJB1P25685 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNAJB1P25685 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNAJB1P25685 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
DNAJB1P25685 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNAJB1P25685 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
DNAJB1P25685 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNAJB1P25685 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNAJB1P25685 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNAJB1P25685 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNAJB1P25685 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DNAJB1P25685 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNAJB1P25685 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DNAJB1P25685 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNAJB1P25685 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNAJB1P25685 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNAJB1P25685 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNAJB1P25685 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNAJB1P25685 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNAJB1P25685 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNAJB1P25685 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNAJB1P25685 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNAJB1P25685 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
DNAJB1P25685 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNAJB1P25685 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DNAJB1P25685 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNAJB1P25685 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNAJB1P25685 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DNAJB1P25685 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DNAJB1P25685 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DNAJB1P25685 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DNAJB1P25685 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
DNAJB1P25685 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DNAJB1P25685 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DNAJB1P25685 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DNAJB1P25685 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DNAJB1P25685 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DNAJB1P25685 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DNAJB1P25685 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
DNAJB1P25685 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAJB1P25685 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAJB1P25685 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAJB1P25685 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAJB1P25685 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DNAJB1P25685 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNAJB1P25685 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNAJB1P25685 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNAJB1P25685 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNAJB1P25685 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
DNAJB1P25685 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNAJB1P25685 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNAJB1P25685 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNAJB1P25685 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNAJB1P25685 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNAJB1P25685 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
DNAJB1P25685 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNAJB1P25685 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNAJB1P25685 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNAJB1P25685 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNAJB1P25685 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNAJB1P25685 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNAJB1P25685 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNAJB1P25685 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNAJB1P25685 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNAJB1P25685 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DNAJB1P25685 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DNAJB1P25685 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DNAJB1P25685 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms