Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCNE1P24864 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCNE1P24864 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCNE1P24864 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCNE1P24864 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCNE1P24864 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCNE1P24864 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCNE1P24864 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCNE1P24864 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCNE1P24864 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCNE1P24864 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCNE1P24864 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCNE1P24864 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCNE1P24864 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCNE1P24864 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCNE1P24864 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCNE1P24864 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCNE1P24864 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCNE1P24864 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCNE1P24864 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCNE1P24864 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCNE1P24864 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCNE1P24864 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCNE1P24864 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCNE1P24864 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCNE1P24864 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCNE1P24864 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCNE1P24864 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCNE1P24864 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCNE1P24864 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CCNE1P24864 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCNE1P24864 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCNE1P24864 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCNE1P24864 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCNE1P24864 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CCNE1P24864 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCNE1P24864 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCNE1P24864 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCNE1P24864 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CCNE1P24864 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCNE1P24864 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCNE1P24864 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCNE1P24864 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCNE1P24864 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCNE1P24864 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCNE1P24864 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCNE1P24864 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCNE1P24864 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCNE1P24864 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCNE1P24864 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCNE1P24864 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCNE1P24864 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCNE1P24864 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCNE1P24864 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCNE1P24864 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCNE1P24864 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCNE1P24864 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCNE1P24864 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCNE1P24864 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCNE1P24864 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCNE1P24864 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCNE1P24864 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCNE1P24864 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCNE1P24864 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCNE1P24864 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNE1P24864 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNE1P24864 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNE1P24864 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNE1P24864 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNE1P24864 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCNE1P24864 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCNE1P24864 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCNE1P24864 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCNE1P24864 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCNE1P24864 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCNE1P24864 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCNE1P24864 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCNE1P24864 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCNE1P24864 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCNE1P24864 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCNE1P24864 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCNE1P24864 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCNE1P24864 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCNE1P24864 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCNE1P24864 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCNE1P24864 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCNE1P24864 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCNE1P24864 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCNE1P24864 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCNE1P24864 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCNE1P24864 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCNE1P24864 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCNE1P24864 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCNE1P24864 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCNE1P24864 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCNE1P24864 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCNE1P24864 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCNE1P24864 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
CCNE1P24864 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCNE1P24864 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms