Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRDP23468 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRDP23468 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRDP23468 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRDP23468 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRDP23468 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRDP23468 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRDP23468 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRDP23468 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRDP23468 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRDP23468 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRDP23468 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRDP23468 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRDP23468 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRDP23468 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRDP23468 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRDP23468 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRDP23468 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRDP23468 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRDP23468 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRDP23468 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRDP23468 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRDP23468 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRDP23468 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRDP23468 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRDP23468 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRDP23468 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRDP23468 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRDP23468 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRDP23468 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRDP23468 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRDP23468 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRDP23468 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRDP23468 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRDP23468 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRDP23468 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRDP23468 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRDP23468 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRDP23468 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRDP23468 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRDP23468 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRDP23468 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRDP23468 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRDP23468 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRDP23468 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRDP23468 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PTPRDP23468 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRDP23468 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRDP23468 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRDP23468 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRDP23468 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRDP23468 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRDP23468 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRDP23468 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRDP23468 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRDP23468 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRDP23468 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRDP23468 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRDP23468 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRDP23468 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRDP23468 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRDP23468 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRDP23468 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRDP23468 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
PTPRDP23468 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRDP23468 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRDP23468 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRDP23468 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRDP23468 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRDP23468 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PTPRDP23468 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRDP23468 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRDP23468 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PTPRDP23468 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRDP23468 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRDP23468 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRDP23468 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRDP23468 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRDP23468 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRDP23468 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRDP23468 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRDP23468 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRDP23468 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRDP23468 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRDP23468 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRDP23468 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRDP23468 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRDP23468 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRDP23468 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRDP23468 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRDP23468 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRDP23468 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRDP23468 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRDP23468 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRDP23468 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRDP23468 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRDP23468 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRDP23468 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRDP23468 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRDP23468 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
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