Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCL3P20749 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCL3P20749 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCL3P20749 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCL3P20749 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCL3P20749 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCL3P20749 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCL3P20749 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCL3P20749 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCL3P20749 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BCL3P20749 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCL3P20749 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCL3P20749 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BCL3P20749 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCL3P20749 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCL3P20749 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BCL3P20749 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BCL3P20749 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BCL3P20749 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BCL3P20749 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BCL3P20749 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BCL3P20749 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BCL3P20749 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BCL3P20749 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BCL3P20749 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BCL3P20749 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BCL3P20749 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BCL3P20749 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BCL3P20749 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BCL3P20749 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BCL3P20749 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BCL3P20749 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BCL3P20749 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCL3P20749 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCL3P20749 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCL3P20749 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCL3P20749 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCL3P20749 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCL3P20749 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCL3P20749 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCL3P20749 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCL3P20749 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCL3P20749 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCL3P20749 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCL3P20749 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BCL3P20749 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCL3P20749 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCL3P20749 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCL3P20749 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCL3P20749 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCL3P20749 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCL3P20749 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCL3P20749 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCL3P20749 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCL3P20749 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCL3P20749 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCL3P20749 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCL3P20749 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCL3P20749 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCL3P20749 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BCL3P20749 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCL3P20749 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BCL3P20749 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCL3P20749 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BCL3P20749 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCL3P20749 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCL3P20749 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCL3P20749 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCL3P20749 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCL3P20749 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCL3P20749 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BCL3P20749 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCL3P20749 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BCL3P20749 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCL3P20749 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCL3P20749 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCL3P20749 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCL3P20749 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BCL3P20749 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCL3P20749 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCL3P20749 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCL3P20749 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCL3P20749 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCL3P20749 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCL3P20749 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCL3P20749 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCL3P20749 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCL3P20749 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BCL3P20749 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCL3P20749 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCL3P20749 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCL3P20749 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCL3P20749 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCL3P20749 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BCL3P20749 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BCL3P20749 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCL3P20749 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCL3P20749 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BCL3P20749 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCL3P20749 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms