Protein–RNA interactions for Protein: P18505

GABRB1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB1P18505 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRB1P18505 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRB1P18505 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRB1P18505 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRB1P18505 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRB1P18505 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRB1P18505 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRB1P18505 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRB1P18505 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRB1P18505 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRB1P18505 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRB1P18505 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRB1P18505 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRB1P18505 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRB1P18505 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRB1P18505 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRB1P18505 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRB1P18505 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRB1P18505 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRB1P18505 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRB1P18505 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRB1P18505 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRB1P18505 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRB1P18505 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRB1P18505 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRB1P18505 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRB1P18505 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRB1P18505 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRB1P18505 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRB1P18505 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRB1P18505 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRB1P18505 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABRB1P18505 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRB1P18505 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRB1P18505 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRB1P18505 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRB1P18505 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRB1P18505 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRB1P18505 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRB1P18505 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRB1P18505 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRB1P18505 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRB1P18505 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRB1P18505 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRB1P18505 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRB1P18505 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRB1P18505 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRB1P18505 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRB1P18505 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRB1P18505 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRB1P18505 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRB1P18505 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRB1P18505 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRB1P18505 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRB1P18505 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRB1P18505 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRB1P18505 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRB1P18505 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRB1P18505 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRB1P18505 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRB1P18505 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRB1P18505 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRB1P18505 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRB1P18505 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRB1P18505 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRB1P18505 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRB1P18505 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRB1P18505 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRB1P18505 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRB1P18505 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRB1P18505 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRB1P18505 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRB1P18505 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB1P18505 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB1P18505 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB1P18505 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRB1P18505 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRB1P18505 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRB1P18505 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB1P18505 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB1P18505 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB1P18505 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB1P18505 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB1P18505 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB1P18505 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRB1P18505 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRB1P18505 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRB1P18505 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
GABRB1P18505 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRB1P18505 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRB1P18505 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GABRB1P18505 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB1P18505 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB1P18505 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB1P18505 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB1P18505 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB1P18505 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB1P18505 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB1P18505 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB1P18505 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms