Protein–RNA interactions for Protein: P15169

CPN1, Carboxypeptidase N catalytic chain, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPN1P15169 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CPN1P15169 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CPN1P15169 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CPN1P15169 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPN1P15169 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPN1P15169 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPN1P15169 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPN1P15169 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPN1P15169 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPN1P15169 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPN1P15169 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPN1P15169 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPN1P15169 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPN1P15169 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPN1P15169 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPN1P15169 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPN1P15169 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPN1P15169 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPN1P15169 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPN1P15169 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPN1P15169 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPN1P15169 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPN1P15169 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPN1P15169 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPN1P15169 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPN1P15169 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CPN1P15169 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPN1P15169 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPN1P15169 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPN1P15169 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPN1P15169 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPN1P15169 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPN1P15169 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CPN1P15169 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPN1P15169 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPN1P15169 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPN1P15169 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPN1P15169 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CPN1P15169 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPN1P15169 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPN1P15169 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPN1P15169 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPN1P15169 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPN1P15169 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPN1P15169 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPN1P15169 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPN1P15169 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPN1P15169 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPN1P15169 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPN1P15169 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPN1P15169 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPN1P15169 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPN1P15169 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPN1P15169 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPN1P15169 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPN1P15169 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPN1P15169 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPN1P15169 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPN1P15169 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CPN1P15169 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPN1P15169 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPN1P15169 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPN1P15169 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPN1P15169 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPN1P15169 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPN1P15169 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPN1P15169 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPN1P15169 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPN1P15169 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPN1P15169 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPN1P15169 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPN1P15169 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPN1P15169 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPN1P15169 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPN1P15169 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPN1P15169 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPN1P15169 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPN1P15169 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPN1P15169 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPN1P15169 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPN1P15169 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPN1P15169 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPN1P15169 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPN1P15169 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPN1P15169 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPN1P15169 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPN1P15169 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPN1P15169 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPN1P15169 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPN1P15169 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPN1P15169 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPN1P15169 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPN1P15169 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPN1P15169 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPN1P15169 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CPN1P15169 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPN1P15169 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPN1P15169 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CPN1P15169 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPN1P15169 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms