Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ETFAP13804 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ETFAP13804 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ETFAP13804 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ETFAP13804 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ETFAP13804 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
ETFAP13804 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ETFAP13804 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ETFAP13804 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ETFAP13804 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ETFAP13804 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ETFAP13804 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ETFAP13804 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ETFAP13804 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ETFAP13804 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ETFAP13804 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ETFAP13804 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ETFAP13804 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ETFAP13804 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ETFAP13804 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ETFAP13804 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ETFAP13804 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ETFAP13804 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ETFAP13804 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ETFAP13804 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ETFAP13804 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ETFAP13804 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ETFAP13804 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ETFAP13804 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ETFAP13804 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ETFAP13804 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ETFAP13804 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ETFAP13804 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ETFAP13804 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ETFAP13804 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ETFAP13804 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ETFAP13804 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ETFAP13804 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ETFAP13804 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ETFAP13804 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ETFAP13804 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ETFAP13804 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ETFAP13804 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ETFAP13804 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ETFAP13804 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ETFAP13804 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ETFAP13804 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ETFAP13804 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ETFAP13804 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ETFAP13804 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ETFAP13804 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ETFAP13804 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ETFAP13804 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ETFAP13804 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ETFAP13804 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ETFAP13804 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ETFAP13804 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ETFAP13804 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ETFAP13804 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ETFAP13804 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ETFAP13804 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ETFAP13804 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ETFAP13804 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ETFAP13804 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ETFAP13804 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ETFAP13804 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ETFAP13804 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ETFAP13804 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ETFAP13804 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ETFAP13804 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ETFAP13804 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ETFAP13804 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ETFAP13804 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ETFAP13804 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ETFAP13804 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ETFAP13804 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ETFAP13804 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ETFAP13804 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ETFAP13804 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ETFAP13804 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ETFAP13804 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ETFAP13804 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ETFAP13804 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ETFAP13804 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ETFAP13804 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ETFAP13804 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ETFAP13804 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ETFAP13804 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ETFAP13804 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ETFAP13804 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ETFAP13804 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ETFAP13804 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ETFAP13804 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ETFAP13804 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ETFAP13804 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ETFAP13804 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ETFAP13804 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ETFAP13804 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ETFAP13804 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ETFAP13804 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms