Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT7P08729 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT7P08729 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT7P08729 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT7P08729 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT7P08729 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT7P08729 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT7P08729 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT7P08729 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT7P08729 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT7P08729 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT7P08729 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT7P08729 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT7P08729 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT7P08729 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT7P08729 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT7P08729 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT7P08729 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT7P08729 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT7P08729 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT7P08729 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT7P08729 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT7P08729 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT7P08729 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT7P08729 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT7P08729 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT7P08729 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT7P08729 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT7P08729 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT7P08729 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT7P08729 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT7P08729 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT7P08729 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT7P08729 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT7P08729 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT7P08729 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT7P08729 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT7P08729 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT7P08729 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT7P08729 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT7P08729 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT7P08729 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT7P08729 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT7P08729 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT7P08729 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT7P08729 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT7P08729 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT7P08729 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT7P08729 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT7P08729 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT7P08729 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT7P08729 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT7P08729 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT7P08729 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT7P08729 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT7P08729 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT7P08729 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT7P08729 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT7P08729 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT7P08729 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT7P08729 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT7P08729 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT7P08729 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT7P08729 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT7P08729 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT7P08729 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT7P08729 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT7P08729 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT7P08729 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT7P08729 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT7P08729 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT7P08729 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT7P08729 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT7P08729 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT7P08729 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT7P08729 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT7P08729 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT7P08729 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT7P08729 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT7P08729 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT7P08729 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT7P08729 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT7P08729 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT7P08729 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT7P08729 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT7P08729 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT7P08729 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT7P08729 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT7P08729 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT7P08729 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT7P08729 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT7P08729 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT7P08729 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT7P08729 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT7P08729 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT7P08729 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT7P08729 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT7P08729 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT7P08729 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT7P08729 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms