Protein–RNA interactions for Protein: P06315

IGKV5-2, Immunoglobulin kappa variable 5-2, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV5-2P06315 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
IGKV5-2P06315 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
IGKV5-2P06315 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
IGKV5-2P06315 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
IGKV5-2P06315 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
IGKV5-2P06315 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
IGKV5-2P06315 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
IGKV5-2P06315 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
IGKV5-2P06315 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
IGKV5-2P06315 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
IGKV5-2P06315 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
IGKV5-2P06315 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
IGKV5-2P06315 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
IGKV5-2P06315 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
IGKV5-2P06315 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
IGKV5-2P06315 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
IGKV5-2P06315 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
IGKV5-2P06315 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
IGKV5-2P06315 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
IGKV5-2P06315 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
IGKV5-2P06315 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
IGKV5-2P06315 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
IGKV5-2P06315 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
IGKV5-2P06315 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
IGKV5-2P06315 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
IGKV5-2P06315 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
IGKV5-2P06315 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
IGKV5-2P06315 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
IGKV5-2P06315 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
IGKV5-2P06315 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
IGKV5-2P06315 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
IGKV5-2P06315 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
IGKV5-2P06315 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
IGKV5-2P06315 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
IGKV5-2P06315 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
IGKV5-2P06315 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
IGKV5-2P06315 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
IGKV5-2P06315 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
IGKV5-2P06315 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
IGKV5-2P06315 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
IGKV5-2P06315 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
IGKV5-2P06315 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
IGKV5-2P06315 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
IGKV5-2P06315 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
IGKV5-2P06315 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
IGKV5-2P06315 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
IGKV5-2P06315 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
IGKV5-2P06315 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
IGKV5-2P06315 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
IGKV5-2P06315 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
IGKV5-2P06315 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
IGKV5-2P06315 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
IGKV5-2P06315 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
IGKV5-2P06315 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
IGKV5-2P06315 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
IGKV5-2P06315 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
IGKV5-2P06315 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms