Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDN1P05305 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDN1P05305 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDN1P05305 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDN1P05305 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDN1P05305 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDN1P05305 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EDN1P05305 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDN1P05305 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDN1P05305 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDN1P05305 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDN1P05305 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDN1P05305 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EDN1P05305 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDN1P05305 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDN1P05305 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDN1P05305 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EDN1P05305 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
EDN1P05305 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EDN1P05305 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDN1P05305 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDN1P05305 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDN1P05305 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
EDN1P05305 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EDN1P05305 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EDN1P05305 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EDN1P05305 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDN1P05305 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDN1P05305 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDN1P05305 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDN1P05305 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDN1P05305 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDN1P05305 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDN1P05305 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDN1P05305 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EDN1P05305 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
EDN1P05305 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EDN1P05305 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EDN1P05305 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EDN1P05305 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EDN1P05305 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
EDN1P05305 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDN1P05305 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDN1P05305 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDN1P05305 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDN1P05305 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDN1P05305 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EDN1P05305 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDN1P05305 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDN1P05305 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDN1P05305 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDN1P05305 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDN1P05305 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDN1P05305 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDN1P05305 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDN1P05305 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDN1P05305 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EDN1P05305 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EDN1P05305 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDN1P05305 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDN1P05305 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDN1P05305 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDN1P05305 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDN1P05305 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDN1P05305 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDN1P05305 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDN1P05305 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDN1P05305 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDN1P05305 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDN1P05305 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
EDN1P05305 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDN1P05305 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDN1P05305 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDN1P05305 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDN1P05305 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDN1P05305 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDN1P05305 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDN1P05305 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDN1P05305 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDN1P05305 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDN1P05305 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDN1P05305 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
EDN1P05305 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDN1P05305 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDN1P05305 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDN1P05305 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDN1P05305 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDN1P05305 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDN1P05305 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDN1P05305 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDN1P05305 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDN1P05305 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EDN1P05305 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDN1P05305 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDN1P05305 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDN1P05305 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EDN1P05305 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDN1P05305 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDN1P05305 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDN1P05305 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms