Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PCCAP05165 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PCCAP05165 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PCCAP05165 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PCCAP05165 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PCCAP05165 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
PCCAP05165 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PCCAP05165 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PCCAP05165 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PCCAP05165 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PCCAP05165 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PCCAP05165 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PCCAP05165 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PCCAP05165 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PCCAP05165 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PCCAP05165 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PCCAP05165 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PCCAP05165 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PCCAP05165 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PCCAP05165 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PCCAP05165 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PCCAP05165 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PCCAP05165 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PCCAP05165 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PCCAP05165 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PCCAP05165 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PCCAP05165 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PCCAP05165 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PCCAP05165 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PCCAP05165 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PCCAP05165 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PCCAP05165 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PCCAP05165 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PCCAP05165 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
PCCAP05165 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PCCAP05165 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PCCAP05165 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PCCAP05165 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PCCAP05165 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PCCAP05165 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PCCAP05165 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PCCAP05165 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PCCAP05165 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PCCAP05165 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PCCAP05165 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PCCAP05165 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PCCAP05165 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PCCAP05165 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PCCAP05165 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PCCAP05165 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PCCAP05165 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PCCAP05165 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PCCAP05165 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PCCAP05165 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PCCAP05165 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PCCAP05165 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PCCAP05165 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PCCAP05165 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PCCAP05165 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PCCAP05165 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PCCAP05165 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PCCAP05165 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PCCAP05165 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PCCAP05165 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PCCAP05165 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
PCCAP05165 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
PCCAP05165 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.73
PCCAP05165 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PCCAP05165 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PCCAP05165 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCCAP05165 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCCAP05165 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCCAP05165 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCCAP05165 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCCAP05165 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PCCAP05165 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PCCAP05165 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PCCAP05165 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PCCAP05165 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
PCCAP05165 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PCCAP05165 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PCCAP05165 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PCCAP05165 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PCCAP05165 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PCCAP05165 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PCCAP05165 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PCCAP05165 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PCCAP05165 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PCCAP05165 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PCCAP05165 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PCCAP05165 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PCCAP05165 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PCCAP05165 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PCCAP05165 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PCCAP05165 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PCCAP05165 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
PCCAP05165 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PCCAP05165 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PCCAP05165 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PCCAP05165 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms