Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
F13BP05160 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
F13BP05160 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
F13BP05160 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
F13BP05160 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
F13BP05160 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
F13BP05160 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13BP05160 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13BP05160 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13BP05160 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13BP05160 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
F13BP05160 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
F13BP05160 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
F13BP05160 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
F13BP05160 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
F13BP05160 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
F13BP05160 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
F13BP05160 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
F13BP05160 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
F13BP05160 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
F13BP05160 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
F13BP05160 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
F13BP05160 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
F13BP05160 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
F13BP05160 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
F13BP05160 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
F13BP05160 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
F13BP05160 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
F13BP05160 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
F13BP05160 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
F13BP05160 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
F13BP05160 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
F13BP05160 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
F13BP05160 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
F13BP05160 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
F13BP05160 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
F13BP05160 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
F13BP05160 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23■■□□□ 1.27
F13BP05160 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
F13BP05160 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
F13BP05160 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
F13BP05160 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
F13BP05160 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
F13BP05160 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
F13BP05160 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F13BP05160 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F13BP05160 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F13BP05160 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F13BP05160 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F13BP05160 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13BP05160 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13BP05160 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13BP05160 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F13BP05160 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F13BP05160 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F13BP05160 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
F13BP05160 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
F13BP05160 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
F13BP05160 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F13BP05160 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
F13BP05160 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
F13BP05160 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
F13BP05160 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13BP05160 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13BP05160 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
F13BP05160 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
F13BP05160 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
F13BP05160 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
F13BP05160 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
F13BP05160 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
F13BP05160 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
F13BP05160 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
F13BP05160 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
F13BP05160 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
F13BP05160 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
F13BP05160 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
F13BP05160 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
F13BP05160 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
F13BP05160 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
F13BP05160 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
F13BP05160 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
F13BP05160 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
F13BP05160 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
F13BP05160 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
F13BP05160 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
F13BP05160 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
F13BP05160 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
F13BP05160 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
F13BP05160 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
F13BP05160 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
F13BP05160 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
F13BP05160 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
F13BP05160 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
F13BP05160 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
F13BP05160 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
F13BP05160 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
F13BP05160 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
F13BP05160 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
F13BP05160 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
F13BP05160 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms