Protein–RNA interactions for Protein: P02766

TTR, Transthyretin, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTRP02766 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TTRP02766 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTRP02766 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTRP02766 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTRP02766 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTRP02766 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TTRP02766 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTRP02766 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTRP02766 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTRP02766 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTRP02766 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTRP02766 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTRP02766 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTRP02766 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTRP02766 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTRP02766 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTRP02766 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTRP02766 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTRP02766 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTRP02766 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTRP02766 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTRP02766 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TTRP02766 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TTRP02766 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTRP02766 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTRP02766 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTRP02766 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTRP02766 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTRP02766 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTRP02766 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TTRP02766 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTRP02766 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTRP02766 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTRP02766 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTRP02766 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTRP02766 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTRP02766 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTRP02766 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTRP02766 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTRP02766 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTRP02766 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTRP02766 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTRP02766 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTRP02766 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTRP02766 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTRP02766 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTRP02766 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTRP02766 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTRP02766 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTRP02766 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTRP02766 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTRP02766 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTRP02766 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTRP02766 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTRP02766 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTRP02766 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTRP02766 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTRP02766 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTRP02766 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTRP02766 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTRP02766 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTRP02766 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTRP02766 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTRP02766 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTRP02766 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTRP02766 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTRP02766 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTRP02766 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTRP02766 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTRP02766 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTRP02766 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TTRP02766 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTRP02766 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTRP02766 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTRP02766 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TTRP02766 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTRP02766 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTRP02766 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TTRP02766 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTRP02766 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTRP02766 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTRP02766 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTRP02766 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTRP02766 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TTRP02766 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTRP02766 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTRP02766 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTRP02766 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTRP02766 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTRP02766 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTRP02766 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTRP02766 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTRP02766 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTRP02766 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTRP02766 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTRP02766 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTRP02766 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTRP02766 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTRP02766 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTRP02766 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms