Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGKV3-15P01624 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IGKV3-15P01624 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGKV3-15P01624 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGKV3-15P01624 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGKV3-15P01624 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGKV3-15P01624 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGKV3-15P01624 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGKV3-15P01624 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGKV3-15P01624 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IGKV3-15P01624 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGKV3-15P01624 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGKV3-15P01624 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGKV3-15P01624 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IGKV3-15P01624 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGKV3-15P01624 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGKV3-15P01624 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGKV3-15P01624 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGKV3-15P01624 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGKV3-15P01624 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGKV3-15P01624 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGKV3-15P01624 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGKV3-15P01624 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGKV3-15P01624 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV3-15P01624 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV3-15P01624 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV3-15P01624 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV3-15P01624 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV3-15P01624 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV3-15P01624 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGKV3-15P01624 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGKV3-15P01624 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGKV3-15P01624 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGKV3-15P01624 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGKV3-15P01624 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IGKV3-15P01624 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV3-15P01624 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV3-15P01624 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV3-15P01624 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV3-15P01624 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV3-15P01624 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV3-15P01624 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV3-15P01624 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV3-15P01624 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV3-15P01624 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV3-15P01624 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV3-15P01624 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV3-15P01624 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGKV3-15P01624 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGKV3-15P01624 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGKV3-15P01624 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGKV3-15P01624 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGKV3-15P01624 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGKV3-15P01624 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGKV3-15P01624 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGKV3-15P01624 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGKV3-15P01624 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms