Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
IGKV3-15P01624 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IGKV3-15P01624 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IGKV3-15P01624 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
IGKV3-15P01624 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IGKV3-15P01624 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IGKV3-15P01624 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGKV3-15P01624 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGKV3-15P01624 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGKV3-15P01624 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGKV3-15P01624 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGKV3-15P01624 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGKV3-15P01624 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IGKV3-15P01624 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGKV3-15P01624 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGKV3-15P01624 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IGKV3-15P01624 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IGKV3-15P01624 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
IGKV3-15P01624 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGKV3-15P01624 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGKV3-15P01624 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGKV3-15P01624 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGKV3-15P01624 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGKV3-15P01624 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
IGKV3-15P01624 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGKV3-15P01624 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IGKV3-15P01624 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGKV3-15P01624 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGKV3-15P01624 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IGKV3-15P01624 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IGKV3-15P01624 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IGKV3-15P01624 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGKV3-15P01624 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGKV3-15P01624 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IGKV3-15P01624 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGKV3-15P01624 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGKV3-15P01624 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IGKV3-15P01624 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IGKV3-15P01624 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGKV3-15P01624 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGKV3-15P01624 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGKV3-15P01624 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGKV3-15P01624 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGKV3-15P01624 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGKV3-15P01624 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGKV3-15P01624 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGKV3-15P01624 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
IGKV3-15P01624 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGKV3-15P01624 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IGKV3-15P01624 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGKV3-15P01624 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGKV3-15P01624 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IGKV3-15P01624 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGKV3-15P01624 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGKV3-15P01624 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGKV3-15P01624 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IGKV3-15P01624 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
IGKV3-15P01624 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IGKV3-15P01624 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IGKV3-15P01624 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
IGKV3-15P01624 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGKV3-15P01624 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGKV3-15P01624 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGKV3-15P01624 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGKV3-15P01624 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGKV3-15P01624 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IGKV3-15P01624 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IGKV3-15P01624 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IGKV3-15P01624 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGKV3-15P01624 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGKV3-15P01624 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGKV3-15P01624 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGKV3-15P01624 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGKV3-15P01624 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGKV3-15P01624 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGKV3-15P01624 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGKV3-15P01624 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGKV3-15P01624 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGKV3-15P01624 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGKV3-15P01624 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGKV3-15P01624 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGKV3-15P01624 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGKV3-15P01624 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGKV3-15P01624 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGKV3-15P01624 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGKV3-15P01624 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGKV3-15P01624 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGKV3-15P01624 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGKV3-15P01624 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGKV3-15P01624 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGKV3-15P01624 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGKV3-15P01624 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGKV3-15P01624 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGKV3-15P01624 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IGKV3-15P01624 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGKV3-15P01624 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGKV3-15P01624 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGKV3-15P01624 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGKV3-15P01624 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGKV3-15P01624 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms