Protein–RNA interactions for Protein: P01011

SERPINA3, Alpha-1-antichymotrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA3P01011 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPINA3P01011 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPINA3P01011 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINA3P01011 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINA3P01011 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINA3P01011 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINA3P01011 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINA3P01011 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINA3P01011 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINA3P01011 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINA3P01011 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINA3P01011 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINA3P01011 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPINA3P01011 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPINA3P01011 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPINA3P01011 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPINA3P01011 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPINA3P01011 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPINA3P01011 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPINA3P01011 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPINA3P01011 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERPINA3P01011 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERPINA3P01011 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERPINA3P01011 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SERPINA3P01011 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SERPINA3P01011 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINA3P01011 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINA3P01011 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINA3P01011 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINA3P01011 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINA3P01011 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINA3P01011 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINA3P01011 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINA3P01011 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINA3P01011 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINA3P01011 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINA3P01011 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINA3P01011 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINA3P01011 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINA3P01011 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINA3P01011 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINA3P01011 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINA3P01011 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINA3P01011 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SERPINA3P01011 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINA3P01011 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINA3P01011 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINA3P01011 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINA3P01011 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINA3P01011 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINA3P01011 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINA3P01011 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINA3P01011 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINA3P01011 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINA3P01011 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINA3P01011 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINA3P01011 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINA3P01011 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINA3P01011 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINA3P01011 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINA3P01011 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINA3P01011 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINA3P01011 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINA3P01011 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINA3P01011 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINA3P01011 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINA3P01011 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINA3P01011 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINA3P01011 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms