Protein–RNA interactions for Protein: P01011

SERPINA3, Alpha-1-antichymotrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA3P01011 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SERPINA3P01011 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SERPINA3P01011 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SERPINA3P01011 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SERPINA3P01011 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SERPINA3P01011 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SERPINA3P01011 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SERPINA3P01011 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SERPINA3P01011 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SERPINA3P01011 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SERPINA3P01011 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SERPINA3P01011 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SERPINA3P01011 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SERPINA3P01011 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SERPINA3P01011 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SERPINA3P01011 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SERPINA3P01011 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SERPINA3P01011 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SERPINA3P01011 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SERPINA3P01011 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SERPINA3P01011 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SERPINA3P01011 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SERPINA3P01011 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SERPINA3P01011 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SERPINA3P01011 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SERPINA3P01011 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SERPINA3P01011 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SERPINA3P01011 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SERPINA3P01011 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SERPINA3P01011 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SERPINA3P01011 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SERPINA3P01011 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SERPINA3P01011 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SERPINA3P01011 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SERPINA3P01011 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SERPINA3P01011 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SERPINA3P01011 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SERPINA3P01011 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SERPINA3P01011 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SERPINA3P01011 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SERPINA3P01011 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SERPINA3P01011 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SERPINA3P01011 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SERPINA3P01011 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SERPINA3P01011 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SERPINA3P01011 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SERPINA3P01011 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SERPINA3P01011 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SERPINA3P01011 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SERPINA3P01011 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SERPINA3P01011 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SERPINA3P01011 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SERPINA3P01011 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SERPINA3P01011 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SERPINA3P01011 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SERPINA3P01011 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SERPINA3P01011 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SERPINA3P01011 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SERPINA3P01011 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SERPINA3P01011 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SERPINA3P01011 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SERPINA3P01011 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SERPINA3P01011 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SERPINA3P01011 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SERPINA3P01011 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SERPINA3P01011 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SERPINA3P01011 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SERPINA3P01011 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SERPINA3P01011 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SERPINA3P01011 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SERPINA3P01011 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SERPINA3P01011 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SERPINA3P01011 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SERPINA3P01011 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SERPINA3P01011 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SERPINA3P01011 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SERPINA3P01011 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SERPINA3P01011 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SERPINA3P01011 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SERPINA3P01011 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SERPINA3P01011 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SERPINA3P01011 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SERPINA3P01011 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SERPINA3P01011 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SERPINA3P01011 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SERPINA3P01011 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SERPINA3P01011 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SERPINA3P01011 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SERPINA3P01011 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SERPINA3P01011 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SERPINA3P01011 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SERPINA3P01011 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SERPINA3P01011 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SERPINA3P01011 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SERPINA3P01011 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SERPINA3P01011 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SERPINA3P01011 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERPINA3P01011 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERPINA3P01011 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPINA3P01011 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms