Protein–RNA interactions for Protein: O95716

RAB3D, Ras-related protein Rab-3D, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3DO95716 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3DO95716 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3DO95716 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3DO95716 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3DO95716 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3DO95716 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3DO95716 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3DO95716 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3DO95716 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3DO95716 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3DO95716 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3DO95716 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3DO95716 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3DO95716 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3DO95716 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3DO95716 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3DO95716 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3DO95716 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAB3DO95716 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3DO95716 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3DO95716 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3DO95716 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3DO95716 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3DO95716 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3DO95716 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3DO95716 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3DO95716 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3DO95716 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3DO95716 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3DO95716 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3DO95716 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3DO95716 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3DO95716 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3DO95716 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3DO95716 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3DO95716 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB3DO95716 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3DO95716 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3DO95716 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3DO95716 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3DO95716 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3DO95716 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3DO95716 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3DO95716 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3DO95716 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3DO95716 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3DO95716 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3DO95716 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3DO95716 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3DO95716 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3DO95716 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3DO95716 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3DO95716 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3DO95716 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3DO95716 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms