Protein–RNA interactions for Protein: O95206

PCDH8, Protocadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH8O95206 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDH8O95206 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDH8O95206 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDH8O95206 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDH8O95206 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDH8O95206 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDH8O95206 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDH8O95206 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDH8O95206 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDH8O95206 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDH8O95206 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCDH8O95206 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCDH8O95206 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDH8O95206 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCDH8O95206 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDH8O95206 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDH8O95206 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDH8O95206 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDH8O95206 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDH8O95206 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDH8O95206 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDH8O95206 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDH8O95206 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDH8O95206 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDH8O95206 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDH8O95206 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDH8O95206 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH8O95206 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH8O95206 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH8O95206 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH8O95206 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH8O95206 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDH8O95206 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDH8O95206 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDH8O95206 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDH8O95206 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDH8O95206 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDH8O95206 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDH8O95206 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDH8O95206 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PCDH8O95206 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDH8O95206 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDH8O95206 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDH8O95206 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDH8O95206 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDH8O95206 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDH8O95206 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDH8O95206 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDH8O95206 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDH8O95206 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDH8O95206 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDH8O95206 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDH8O95206 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDH8O95206 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDH8O95206 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDH8O95206 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDH8O95206 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDH8O95206 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDH8O95206 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDH8O95206 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDH8O95206 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDH8O95206 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDH8O95206 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDH8O95206 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDH8O95206 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDH8O95206 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDH8O95206 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDH8O95206 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms