Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UPP2O95045 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UPP2O95045 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UPP2O95045 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UPP2O95045 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UPP2O95045 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UPP2O95045 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UPP2O95045 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UPP2O95045 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UPP2O95045 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UPP2O95045 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UPP2O95045 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UPP2O95045 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UPP2O95045 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UPP2O95045 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UPP2O95045 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UPP2O95045 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UPP2O95045 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UPP2O95045 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UPP2O95045 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
UPP2O95045 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UPP2O95045 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UPP2O95045 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UPP2O95045 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UPP2O95045 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UPP2O95045 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
UPP2O95045 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UPP2O95045 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UPP2O95045 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UPP2O95045 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UPP2O95045 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UPP2O95045 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UPP2O95045 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UPP2O95045 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
UPP2O95045 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UPP2O95045 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UPP2O95045 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UPP2O95045 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
UPP2O95045 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UPP2O95045 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UPP2O95045 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UPP2O95045 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UPP2O95045 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UPP2O95045 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UPP2O95045 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
UPP2O95045 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UPP2O95045 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UPP2O95045 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UPP2O95045 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UPP2O95045 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UPP2O95045 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UPP2O95045 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
UPP2O95045 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UPP2O95045 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UPP2O95045 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UPP2O95045 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UPP2O95045 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UPP2O95045 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UPP2O95045 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UPP2O95045 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UPP2O95045 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UPP2O95045 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
UPP2O95045 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
UPP2O95045 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UPP2O95045 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UPP2O95045 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UPP2O95045 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UPP2O95045 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UPP2O95045 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UPP2O95045 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UPP2O95045 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPP2O95045 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPP2O95045 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPP2O95045 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPP2O95045 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UPP2O95045 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UPP2O95045 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UPP2O95045 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UPP2O95045 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UPP2O95045 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UPP2O95045 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
UPP2O95045 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
UPP2O95045 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UPP2O95045 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UPP2O95045 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
UPP2O95045 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UPP2O95045 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UPP2O95045 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UPP2O95045 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UPP2O95045 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
UPP2O95045 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
UPP2O95045 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UPP2O95045 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
UPP2O95045 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UPP2O95045 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UPP2O95045 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UPP2O95045 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
UPP2O95045 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
UPP2O95045 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UPP2O95045 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms