Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGA10O75578 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGA10O75578 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA10O75578 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA10O75578 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA10O75578 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA10O75578 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA10O75578 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA10O75578 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA10O75578 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA10O75578 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA10O75578 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA10O75578 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA10O75578 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA10O75578 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA10O75578 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA10O75578 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA10O75578 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA10O75578 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA10O75578 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA10O75578 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA10O75578 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA10O75578 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA10O75578 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA10O75578 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA10O75578 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA10O75578 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA10O75578 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA10O75578 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA10O75578 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA10O75578 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA10O75578 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA10O75578 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA10O75578 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA10O75578 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA10O75578 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA10O75578 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA10O75578 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA10O75578 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA10O75578 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA10O75578 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA10O75578 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA10O75578 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA10O75578 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA10O75578 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA10O75578 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA10O75578 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA10O75578 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA10O75578 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA10O75578 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA10O75578 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA10O75578 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA10O75578 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA10O75578 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA10O75578 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA10O75578 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA10O75578 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA10O75578 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA10O75578 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA10O75578 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA10O75578 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA10O75578 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA10O75578 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA10O75578 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA10O75578 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA10O75578 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA10O75578 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA10O75578 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA10O75578 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA10O75578 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA10O75578 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms