Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSDE1O75534 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSDE1O75534 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSDE1O75534 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSDE1O75534 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSDE1O75534 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSDE1O75534 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSDE1O75534 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSDE1O75534 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSDE1O75534 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSDE1O75534 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSDE1O75534 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSDE1O75534 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSDE1O75534 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CSDE1O75534 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CSDE1O75534 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CSDE1O75534 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CSDE1O75534 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CSDE1O75534 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSDE1O75534 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CSDE1O75534 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSDE1O75534 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSDE1O75534 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSDE1O75534 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSDE1O75534 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSDE1O75534 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CSDE1O75534 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CSDE1O75534 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CSDE1O75534 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CSDE1O75534 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CSDE1O75534 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CSDE1O75534 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CSDE1O75534 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSDE1O75534 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSDE1O75534 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSDE1O75534 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSDE1O75534 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSDE1O75534 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSDE1O75534 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSDE1O75534 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSDE1O75534 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSDE1O75534 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSDE1O75534 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSDE1O75534 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSDE1O75534 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSDE1O75534 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSDE1O75534 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSDE1O75534 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSDE1O75534 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSDE1O75534 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSDE1O75534 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSDE1O75534 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSDE1O75534 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSDE1O75534 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms