Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F6O75461 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F6O75461 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F6O75461 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F6O75461 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F6O75461 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F6O75461 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
E2F6O75461 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
E2F6O75461 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2F6O75461 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2F6O75461 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2F6O75461 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F6O75461 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F6O75461 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F6O75461 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F6O75461 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F6O75461 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F6O75461 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F6O75461 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F6O75461 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F6O75461 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F6O75461 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F6O75461 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F6O75461 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F6O75461 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F6O75461 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F6O75461 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F6O75461 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F6O75461 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F6O75461 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F6O75461 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F6O75461 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F6O75461 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F6O75461 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F6O75461 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
E2F6O75461 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
E2F6O75461 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
E2F6O75461 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
E2F6O75461 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
E2F6O75461 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
E2F6O75461 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F6O75461 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F6O75461 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F6O75461 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F6O75461 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F6O75461 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F6O75461 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F6O75461 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F6O75461 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F6O75461 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F6O75461 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F6O75461 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F6O75461 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F6O75461 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F6O75461 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F6O75461 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F6O75461 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F6O75461 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F6O75461 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F6O75461 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F6O75461 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F6O75461 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F6O75461 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F6O75461 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F6O75461 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F6O75461 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F6O75461 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F6O75461 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F6O75461 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F6O75461 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F6O75461 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F6O75461 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F6O75461 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F6O75461 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F6O75461 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F6O75461 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F6O75461 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F6O75461 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F6O75461 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F6O75461 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F6O75461 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F6O75461 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F6O75461 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F6O75461 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F6O75461 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F6O75461 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F6O75461 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F6O75461 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F6O75461 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F6O75461 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F6O75461 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F6O75461 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F6O75461 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F6O75461 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F6O75461 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F6O75461 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F6O75461 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
E2F6O75461 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
E2F6O75461 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F6O75461 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms