Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSX5O60225 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSX5O60225 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSX5O60225 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSX5O60225 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX5O60225 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX5O60225 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX5O60225 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX5O60225 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX5O60225 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSX5O60225 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSX5O60225 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSX5O60225 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSX5O60225 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSX5O60225 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSX5O60225 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSX5O60225 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSX5O60225 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX5O60225 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX5O60225 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX5O60225 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX5O60225 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX5O60225 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX5O60225 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX5O60225 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX5O60225 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX5O60225 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX5O60225 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSX5O60225 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSX5O60225 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSX5O60225 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSX5O60225 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSX5O60225 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX5O60225 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX5O60225 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX5O60225 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX5O60225 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX5O60225 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX5O60225 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSX5O60225 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX5O60225 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX5O60225 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSX5O60225 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSX5O60225 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSX5O60225 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX5O60225 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX5O60225 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX5O60225 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX5O60225 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX5O60225 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX5O60225 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX5O60225 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX5O60225 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSX5O60225 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSX5O60225 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSX5O60225 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSX5O60225 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSX5O60225 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSX5O60225 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX5O60225 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX5O60225 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX5O60225 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX5O60225 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX5O60225 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX5O60225 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX5O60225 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX5O60225 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSX5O60225 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSX5O60225 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSX5O60225 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSX5O60225 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSX5O60225 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX5O60225 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX5O60225 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX5O60225 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX5O60225 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX5O60225 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX5O60225 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX5O60225 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX5O60225 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX5O60225 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX5O60225 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX5O60225 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX5O60225 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX5O60225 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX5O60225 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX5O60225 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX5O60225 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX5O60225 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX5O60225 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX5O60225 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX5O60225 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX5O60225 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX5O60225 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX5O60225 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX5O60225 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX5O60225 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX5O60225 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX5O60225 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX5O60225 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms