Protein–RNA interactions for Protein: O43491

EPB41L2, Band 4.1-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,005 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L2O43491 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
EPB41L2O43491 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
EPB41L2O43491 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
EPB41L2O43491 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
EPB41L2O43491 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
EPB41L2O43491 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
EPB41L2O43491 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
EPB41L2O43491 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
EPB41L2O43491 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
EPB41L2O43491 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
EPB41L2O43491 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
EPB41L2O43491 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
EPB41L2O43491 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
EPB41L2O43491 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
EPB41L2O43491 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
EPB41L2O43491 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
EPB41L2O43491 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
EPB41L2O43491 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
EPB41L2O43491 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
EPB41L2O43491 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
EPB41L2O43491 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EPB41L2O43491 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EPB41L2O43491 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EPB41L2O43491 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
EPB41L2O43491 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
EPB41L2O43491 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
EPB41L2O43491 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
EPB41L2O43491 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EPB41L2O43491 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EPB41L2O43491 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
EPB41L2O43491 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
EPB41L2O43491 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EPB41L2O43491 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
EPB41L2O43491 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
EPB41L2O43491 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
EPB41L2O43491 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
EPB41L2O43491 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EPB41L2O43491 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
EPB41L2O43491 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
EPB41L2O43491 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
EPB41L2O43491 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
EPB41L2O43491 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
EPB41L2O43491 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EPB41L2O43491 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
EPB41L2O43491 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
EPB41L2O43491 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
EPB41L2O43491 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
EPB41L2O43491 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
EPB41L2O43491 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
EPB41L2O43491 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
EPB41L2O43491 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
EPB41L2O43491 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
EPB41L2O43491 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
EPB41L2O43491 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
EPB41L2O43491 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
EPB41L2O43491 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
EPB41L2O43491 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
EPB41L2O43491 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
EPB41L2O43491 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
EPB41L2O43491 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
EPB41L2O43491 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
EPB41L2O43491 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
EPB41L2O43491 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
EPB41L2O43491 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
EPB41L2O43491 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
EPB41L2O43491 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
EPB41L2O43491 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
EPB41L2O43491 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms