Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms