Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ACOX3O15254 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ACOX3O15254 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ACOX3O15254 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ACOX3O15254 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
ACOX3O15254 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ACOX3O15254 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ACOX3O15254 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ACOX3O15254 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ACOX3O15254 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ACOX3O15254 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ACOX3O15254 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ACOX3O15254 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ACOX3O15254 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ACOX3O15254 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ACOX3O15254 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ACOX3O15254 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ACOX3O15254 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ACOX3O15254 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ACOX3O15254 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ACOX3O15254 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ACOX3O15254 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ACOX3O15254 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ACOX3O15254 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ACOX3O15254 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ACOX3O15254 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ACOX3O15254 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ACOX3O15254 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ACOX3O15254 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ACOX3O15254 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ACOX3O15254 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ACOX3O15254 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ACOX3O15254 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ACOX3O15254 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACOX3O15254 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACOX3O15254 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ACOX3O15254 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ACOX3O15254 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ACOX3O15254 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ACOX3O15254 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ACOX3O15254 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ACOX3O15254 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ACOX3O15254 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ACOX3O15254 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACOX3O15254 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACOX3O15254 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ACOX3O15254 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACOX3O15254 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACOX3O15254 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACOX3O15254 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACOX3O15254 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACOX3O15254 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACOX3O15254 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACOX3O15254 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACOX3O15254 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACOX3O15254 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACOX3O15254 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACOX3O15254 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACOX3O15254 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACOX3O15254 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACOX3O15254 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACOX3O15254 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACOX3O15254 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ACOX3O15254 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACOX3O15254 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACOX3O15254 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ACOX3O15254 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACOX3O15254 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACOX3O15254 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACOX3O15254 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACOX3O15254 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACOX3O15254 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACOX3O15254 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ACOX3O15254 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ACOX3O15254 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACOX3O15254 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACOX3O15254 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACOX3O15254 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACOX3O15254 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACOX3O15254 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACOX3O15254 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACOX3O15254 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ACOX3O15254 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACOX3O15254 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ACOX3O15254 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACOX3O15254 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ACOX3O15254 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ACOX3O15254 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ACOX3O15254 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ACOX3O15254 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACOX3O15254 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACOX3O15254 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACOX3O15254 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACOX3O15254 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACOX3O15254 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACOX3O15254 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACOX3O15254 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACOX3O15254 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACOX3O15254 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ACOX3O15254 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms