Protein–RNA interactions for Protein: C9JG80

NPIPB4, Nuclear pore complex-interacting protein family member B4, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB4C9JG80 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPB4C9JG80 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPB4C9JG80 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPB4C9JG80 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPB4C9JG80 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPB4C9JG80 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPIPB4C9JG80 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPIPB4C9JG80 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NPIPB4C9JG80 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPIPB4C9JG80 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPIPB4C9JG80 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPIPB4C9JG80 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPIPB4C9JG80 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPB4C9JG80 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPB4C9JG80 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPB4C9JG80 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPB4C9JG80 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPB4C9JG80 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPB4C9JG80 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB4C9JG80 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB4C9JG80 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB4C9JG80 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB4C9JG80 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB4C9JG80 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPB4C9JG80 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPB4C9JG80 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPB4C9JG80 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPB4C9JG80 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPB4C9JG80 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPB4C9JG80 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPB4C9JG80 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPB4C9JG80 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPB4C9JG80 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPB4C9JG80 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPB4C9JG80 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPB4C9JG80 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPB4C9JG80 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPB4C9JG80 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPB4C9JG80 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPB4C9JG80 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPB4C9JG80 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPB4C9JG80 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPB4C9JG80 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPB4C9JG80 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPB4C9JG80 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPB4C9JG80 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPB4C9JG80 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPB4C9JG80 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPB4C9JG80 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB4C9JG80 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB4C9JG80 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB4C9JG80 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB4C9JG80 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB4C9JG80 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB4C9JG80 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB4C9JG80 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB4C9JG80 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB4C9JG80 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB4C9JG80 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB4C9JG80 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB4C9JG80 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPB4C9JG80 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPB4C9JG80 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPB4C9JG80 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPB4C9JG80 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB4C9JG80 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB4C9JG80 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPB4C9JG80 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPB4C9JG80 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPB4C9JG80 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPB4C9JG80 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPB4C9JG80 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB4C9JG80 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB4C9JG80 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB4C9JG80 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPB4C9JG80 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPB4C9JG80 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPB4C9JG80 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPB4C9JG80 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPB4C9JG80 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPB4C9JG80 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPB4C9JG80 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPB4C9JG80 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPB4C9JG80 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPB4C9JG80 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPB4C9JG80 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPB4C9JG80 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPB4C9JG80 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPB4C9JG80 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPB4C9JG80 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPB4C9JG80 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPB4C9JG80 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPB4C9JG80 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPB4C9JG80 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB4C9JG80 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB4C9JG80 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB4C9JG80 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB4C9JG80 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPB4C9JG80 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPB4C9JG80 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms