Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP27XA6NNY8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP27XA6NNY8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP27XA6NNY8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP27XA6NNY8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP27XA6NNY8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP27XA6NNY8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP27XA6NNY8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP27XA6NNY8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP27XA6NNY8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP27XA6NNY8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP27XA6NNY8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP27XA6NNY8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP27XA6NNY8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP27XA6NNY8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP27XA6NNY8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP27XA6NNY8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP27XA6NNY8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP27XA6NNY8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP27XA6NNY8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
USP27XA6NNY8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP27XA6NNY8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP27XA6NNY8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP27XA6NNY8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP27XA6NNY8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP27XA6NNY8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP27XA6NNY8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP27XA6NNY8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP27XA6NNY8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP27XA6NNY8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP27XA6NNY8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
USP27XA6NNY8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP27XA6NNY8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP27XA6NNY8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP27XA6NNY8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP27XA6NNY8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP27XA6NNY8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP27XA6NNY8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP27XA6NNY8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP27XA6NNY8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP27XA6NNY8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP27XA6NNY8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP27XA6NNY8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP27XA6NNY8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP27XA6NNY8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP27XA6NNY8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP27XA6NNY8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
USP27XA6NNY8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP27XA6NNY8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP27XA6NNY8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP27XA6NNY8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP27XA6NNY8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP27XA6NNY8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP27XA6NNY8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP27XA6NNY8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP27XA6NNY8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP27XA6NNY8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP27XA6NNY8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP27XA6NNY8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP27XA6NNY8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP27XA6NNY8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP27XA6NNY8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP27XA6NNY8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP27XA6NNY8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP27XA6NNY8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP27XA6NNY8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP27XA6NNY8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP27XA6NNY8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP27XA6NNY8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP27XA6NNY8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP27XA6NNY8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
USP27XA6NNY8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP27XA6NNY8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP27XA6NNY8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP27XA6NNY8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP27XA6NNY8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP27XA6NNY8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP27XA6NNY8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP27XA6NNY8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP27XA6NNY8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP27XA6NNY8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP27XA6NNY8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP27XA6NNY8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP27XA6NNY8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP27XA6NNY8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP27XA6NNY8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP27XA6NNY8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP27XA6NNY8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
USP27XA6NNY8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
USP27XA6NNY8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
USP27XA6NNY8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP27XA6NNY8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP27XA6NNY8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP27XA6NNY8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP27XA6NNY8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
USP27XA6NNY8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP27XA6NNY8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP27XA6NNY8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP27XA6NNY8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP27XA6NNY8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms