Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP73A6NFT4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP73A6NFT4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP73A6NFT4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP73A6NFT4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP73A6NFT4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP73A6NFT4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP73A6NFT4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP73A6NFT4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP73A6NFT4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP73A6NFT4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP73A6NFT4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP73A6NFT4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP73A6NFT4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP73A6NFT4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP73A6NFT4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP73A6NFT4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP73A6NFT4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP73A6NFT4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP73A6NFT4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP73A6NFT4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP73A6NFT4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP73A6NFT4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP73A6NFT4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP73A6NFT4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP73A6NFT4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP73A6NFT4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP73A6NFT4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP73A6NFT4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP73A6NFT4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP73A6NFT4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP73A6NFT4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP73A6NFT4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP73A6NFT4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP73A6NFT4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP73A6NFT4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP73A6NFT4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP73A6NFT4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP73A6NFT4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP73A6NFT4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP73A6NFT4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP73A6NFT4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP73A6NFT4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP73A6NFT4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP73A6NFT4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP73A6NFT4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP73A6NFT4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP73A6NFT4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP73A6NFT4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP73A6NFT4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP73A6NFT4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP73A6NFT4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP73A6NFT4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP73A6NFT4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP73A6NFT4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms