Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
USP17L4A6NCW7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
USP17L4A6NCW7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
USP17L4A6NCW7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
USP17L4A6NCW7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
USP17L4A6NCW7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
USP17L4A6NCW7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
USP17L4A6NCW7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
USP17L4A6NCW7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
USP17L4A6NCW7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
USP17L4A6NCW7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
USP17L4A6NCW7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
USP17L4A6NCW7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
USP17L4A6NCW7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
USP17L4A6NCW7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
USP17L4A6NCW7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
USP17L4A6NCW7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
USP17L4A6NCW7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
USP17L4A6NCW7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
USP17L4A6NCW7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
USP17L4A6NCW7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
USP17L4A6NCW7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
USP17L4A6NCW7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
USP17L4A6NCW7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
USP17L4A6NCW7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
USP17L4A6NCW7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
USP17L4A6NCW7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
USP17L4A6NCW7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
USP17L4A6NCW7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
USP17L4A6NCW7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
USP17L4A6NCW7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
USP17L4A6NCW7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
USP17L4A6NCW7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
USP17L4A6NCW7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
USP17L4A6NCW7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
USP17L4A6NCW7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
USP17L4A6NCW7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
USP17L4A6NCW7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
USP17L4A6NCW7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
USP17L4A6NCW7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
USP17L4A6NCW7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
USP17L4A6NCW7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
USP17L4A6NCW7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
USP17L4A6NCW7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
USP17L4A6NCW7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
USP17L4A6NCW7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
USP17L4A6NCW7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
USP17L4A6NCW7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
USP17L4A6NCW7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
USP17L4A6NCW7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
USP17L4A6NCW7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
USP17L4A6NCW7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
USP17L4A6NCW7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
USP17L4A6NCW7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
USP17L4A6NCW7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
USP17L4A6NCW7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
USP17L4A6NCW7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
USP17L4A6NCW7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
USP17L4A6NCW7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
USP17L4A6NCW7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
USP17L4A6NCW7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
USP17L4A6NCW7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
USP17L4A6NCW7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
USP17L4A6NCW7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
USP17L4A6NCW7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
USP17L4A6NCW7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
USP17L4A6NCW7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
USP17L4A6NCW7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
USP17L4A6NCW7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
USP17L4A6NCW7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
USP17L4A6NCW7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
USP17L4A6NCW7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
USP17L4A6NCW7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
USP17L4A6NCW7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
USP17L4A6NCW7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
USP17L4A6NCW7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
USP17L4A6NCW7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
USP17L4A6NCW7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
USP17L4A6NCW7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
USP17L4A6NCW7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
USP17L4A6NCW7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
USP17L4A6NCW7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
USP17L4A6NCW7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
USP17L4A6NCW7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
USP17L4A6NCW7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
USP17L4A6NCW7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
USP17L4A6NCW7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
USP17L4A6NCW7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
USP17L4A6NCW7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
USP17L4A6NCW7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
USP17L4A6NCW7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
USP17L4A6NCW7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
USP17L4A6NCW7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
USP17L4A6NCW7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
USP17L4A6NCW7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
USP17L4A6NCW7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
USP17L4A6NCW7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
USP17L4A6NCW7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
USP17L4A6NCW7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
USP17L4A6NCW7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms