Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J293

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J293 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
A0A0B4J293 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0B4J293 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0B4J293 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0B4J293 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0B4J293 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0B4J293 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0B4J293 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0B4J293 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0B4J293 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0B4J293 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0B4J293 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0B4J293 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0B4J293 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0B4J293 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0B4J293 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0B4J293 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0B4J293 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0B4J293 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0B4J293 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0B4J293 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0B4J293 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0B4J293 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
A0A0B4J293 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0B4J293 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0B4J293 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0B4J293 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0B4J293 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0B4J293 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0B4J293 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0B4J293 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0B4J293 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0B4J293 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0B4J293 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0B4J293 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0B4J293 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0B4J293 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0B4J293 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0B4J293 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0B4J293 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0B4J293 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0B4J293 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0B4J293 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0B4J293 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A0B4J293 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A0B4J293 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A0B4J293 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A0B4J293 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A0B4J293 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0B4J293 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0B4J293 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0B4J293 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0B4J293 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0B4J293 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0B4J293 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0B4J293 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0B4J293 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0B4J293 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0B4J293 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0B4J293 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0B4J293 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0B4J293 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0B4J293 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms