Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms