Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NREPQ16612 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NREPQ16612 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NREPQ16612 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NREPQ16612 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NREPQ16612 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NREPQ16612 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NREPQ16612 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NREPQ16612 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NREPQ16612 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NREPQ16612 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NREPQ16612 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NREPQ16612 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NREPQ16612 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NREPQ16612 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NREPQ16612 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NREPQ16612 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NREPQ16612 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NREPQ16612 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NREPQ16612 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NREPQ16612 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NREPQ16612 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NREPQ16612 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NREPQ16612 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NREPQ16612 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NREPQ16612 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NREPQ16612 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NREPQ16612 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NREPQ16612 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NREPQ16612 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms